Thomas, Teresa und die Überlebenden haben das Labyrinth hinter sich gelassen und sind nun in der Brandwüste. Dort müssen sie mit wenig Nahrung überleben, während WCKD-Wachen sie verfolgen und neue Gefahren lauern. Die unberechenbaren Bedingungen der Wüste stellen die Gruppe vor Herausforderungen. Sie entdecken Hinweise auf WCKDs Plan und treffen einen Verbündeten, der ihnen helfen könnte, die Brandwüste zu verlassen.