Als Ergebnis eines genetischen Experiments, durch das er überlegene Intelligenz und übermenschliche Fähigkeiten besitzt, ist Agent 47 zu einer perfekten Tötungsmaschine geworden. Gemeinsam mit einer mysteriösen jungen Frau kommt er den Geheimnissen über seine Herkunft auf die Spur und gerät in einen epischen Kampf gegen seinen Todfeind.